作为高通量测序手艺的主要代表,,,,,,全外显子组测序(WES)、全基因组测序(WGS)会爆发海量的基因数据,,,,,,并普遍应用于疾病诊断、遗传病筛查、用药指导等领域。。。。。。。以WES为例,,,,,,通常情形下,,,,,,一次检测可能会爆发出80000条变异效果,,,,,,但大部分是滋扰信息。。。。。。。古板的生物信息学剖析能把效果缩小到近800条的规模内,,,,,,但仍然需要大宗的筛选事情。。。。。。。怎样又快又准地筛选出与患者病情直接相关的致病变异,,,,,,成为临床开展精准诊疗的要害。。。。。。。
针对这一需求,,,,,,2121非凡“基因领航”生物信息剖析一体机,,,,,,装置上了PhenoCompass表型罗盘这个“智慧导航仪”。。。。。。。只需输入患者的病史等临床形貌信息,,,,,,系统便会将其秒级转化为标准HPO(人类表型数据库)术语,,,,,,并凭证“表型-基因”匹配度给所有相关基因举行排序,,,,,,把候选变异的数目从三位数聚拢至个位数,,,,,,让致病变异“自动浮出水面”,,,,,,大幅提高了临床解读效率。。。。。。。

PhenoCompass表型罗盘是“基因领航”一体机的两大智能引擎之一,,,,,,具备表型识别与标准化、疾病基因剖析等焦点功效。。。。。。。下面,,,,,,我们来看看PhenoCompass表型罗盘是怎样定位致病变异的——
第一步:输入临床形貌,,,,,,AI识别表型
登录系统后,,,,,,在输入框内输入临床信息文本(例如临床诊断血钾浓度2.3),,,,,,点击“AI识别表型”按钮,,,,,,就可以用内置的DeepSeek自动匹配临床表型和疾病名称,,,,,,获得响应的词条(如下图中的血钾浓度、低钾血症)。。。。。。。

第二步:表型标准化
点击“表型标准化”按钮,,,,,,即可把AI提供的词条转化为标准的HPO术语或者疾病名称,,,,,,以便精准匹配数据库中的疾病和表型信息。。。。。。。

第三步:疾病基因剖析
点击“疾病基因剖析”按钮,,,,,,系统便最先自动匹配,,,,,,输出可能的疾病以及需要重点关注的基因信息,,,,,,并凭证可能性的崎岖举行排序展示。。。。。。。用户还能下载疾病和基因信息,,,,,,审查详情。。。。。。。若是您有相关生信剖析履历,,,,,,可以将该效果用于生信剖析流程变异过滤或者变异排序,,,,,,可大大提高事情效率。。。。。。。

选用300例WES阳性数据对PhenoCompass表型罗盘的模子举行训练,,,,,,选用154例WES阳性数据用于验证,,,,,,通过比照发明,,,,,,PhenoCompass的排序效果较为优异,,,,,,53.9%的阳性变异都排在其输出效果的Top 5之内。。。。。。。

A:PhenoCompass疾病打分模子测试、验证数据集漫衍。。。。。。。B:模子参数调试流程图。。。。。。。C:验证数据集剖析示意图。。。。。。。D:验证数据集阳性变异排序占比漫衍图。。。。。。。
体验方法
首先,,,,,,发送邮件至ngs-bioinfo@dazd.cn申请体验。。。。。。。(邮件问题为“表型罗盘试用申请”,,,,,,邮件内容需注明您的姓名、手机号码、事情单位及职务。。。。。。。请注重,,,,,,手机号码将作为您的登录账号,,,,,,请务必填写准确。。。。。。。)
通过申请后,,,,,,手机或电脑会见官网https://phenocompass.dazd.cn/即可体验。。。。。。。